Картирование локусов количественных признаков (ЛКП)

Описанный чуть повыше способ анализа сцепления в традиционном варианте, обычно, употребляется для других признаков, наследуемых по Менделю. Для количественных признаков разработана несколько отличающаяся модель картирования - это так именуемый способ QTL (Quantitative Trait Loci), либо картирование ЛКП (локусов количественных признаков). ЛКП представляют собой полигенные системы, обеспечивающие непрерывную вариативность признака в популяции.
Способ картирования Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) ЛКП основывается на исследовании ДНК у пар близких родственников, в большинстве случаев сибсов. Мысль его очень ординарна. Мы уже знаем, что сибсы имеют в среднем приблизительно 50% общих аллелей. В каждой определенной паре сибсов совпадающие аллели будут отличаться. Таким макаром, у деток одних и тех же родителей Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) в данном локусе аллели мамы и отца могут представлять разные сочетания (рис. 8.6).
Разглядим ген, который имеет четыре аллеля: А, В, С, D. Допустим, мама обладает аллелями А и В, а отец - аллелями С и D. Каждый ребенок может получить от мамы один из ее аллелей (А либо В) и от отца - один Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) из его аллелей (С либо D), при всем этом ребенок наследует собственный генотип независимо от других деток в этой семье. Соответственно вероятны четыре разных сочетания. Сопоставление генотипов, представленных на рисунке, указывает, что хоть какой ребенок в этой семье, унаследовавший, например, генотип АС, может иметь от 0 до Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) 2 общих аллелей с хоть каким из собственных братьев и сестер. Представим, мы выявили пару сибсов, которые имеют два общих аллеля. Эти сибсы оказались более схожими по какому-либо количественному признаку, чем сибсы, имеющие один общий аллель. Последние, в свою очередь, нашли большее сходство, чем те сибсы, у каких общих аллелей в Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) этом локусе не было совершенно. На основании этих наблюдений, мы можем полагать, что этот ген оказывает влияние на интересующий нас количественный признак. Если разница в количестве совпадающих аллелей никак не отражается на количественных соотношениях признака у сибсов, означает протестированный ген не имеет дела к изучаемому признаку. Обычно при Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) таком подходе заместо реальных генов употребляются маркеры и рассчитываются корреляции меж наличием маркера и степенью выраженности количественного признака. При анализе группы "количественных локусов" корреляции рассчитываются для каждого из нескольких маркеров, расположенных на определенном участке хромосомы. Величина коэффициентов изменяется от локуса к локусу. На основании предстоящего анализа определяют участок предполагаемой локализации Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) гена, вносящего собственный вклад в количественный признак.
В неком смысле способ картирования ЛКП с внедрением пар сибсов припоминает близнецовый способ: сибсы, у каких совпадают оба аллеля подобны МЗ близнецам (100% общих генов). Сибсы, у каких совпадает 1 аллель подобны ДЗ близнецам (50% общих генов). Сибсы, не имеющие совпадений, подобны неродственникам (0% общих генов Картирование локусов количественных признаков (ЛКП)).
Целью картирования ЛКП является поиск не единичного гена, определяющего непростой признак, а быстрее множественных генов, принимающих роль в формировании популяционной вариативности по изучаемой характеристике. Способ картирования ЛКП довольно эффективен для выявления деяния так именуемых основных генов, т.е. генов, вносящих основной вклад в формирование количественного признака.
Представим, имеется ген, роль Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) которого определяет 10% вариативности признака, не считая того, существует еще 5 генов, любой из которых дает вклад в 2%, и еще 10 других генов с вкладом в изменчивость в 1%. Если эффекты этих ЛКП (либо QTL) независимы, то они все совместно будут определять 30% вариативности (10 + 2•5 + 1•10 = 30). Для генов, наследуемых по Менделю и имеющих вклад, оцениваемый в Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) 100%, эффект порядка 10% может показаться очень малым. Но для разных психологических расстройств таковой вклад считается довольно огромным. На сегодня способ картирования ЛКП употребляется для исследования количественных признаков либо болезней с наследной расположенностью и обладает разрешающей способностью, позволяющей выявлять гены с эффектом порядка 10% (Plomin R., McGuffin P., 2003). Малые эффекты (порядка 1%) пока Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) недосягаемы для обнаружения. Непременно, что поиск генов всеохватывающих болезней и других мультифакториальных признаков представляет собой очень сложную задачку.
Посреди разных подходов, применяемых в способе картирования ЛКП, более пользующимся популярностью является анализ сибсовых пар (sibpair QTL linkage analysis), принцип которого разобран выше. Более нередко применяемый вариант этого способа Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) - модель пораженной пары (affected sibpair design). При таковой схеме исследования оба сибсовых напарника имеют однообразный диагноз либо последнее выражение какого-нибудь количественного признака. В среднем у сибсов должно наблюдаться совпадение в одном из 2-ух аллелей (50%). Связь тестируемого участка хромосомы с заболеванием можно полагать, если у пораженных заболеванием (т.е. конкордантных) сибсов Картирование локусов количественных признаков (ЛКП) совпадение аллелей будет наблюдаться в еще большем проценте случаев, чем ожидаемые 50%.


kartogrammi-i-kartodiagrammi.html
kartoteka-diagnosticheskih-metodik.html
kartoteka-igr-dlya-razvitiya-melkoj-motoriki.html